法医DNA鉴定实验常见问题解答
1、    Chelex配制需要注意哪些方面?     
推荐按每次检验的实际消耗少量配制,迅速用完。不推荐一次配制较大的体积,长时间使用。
 
2、    Identifiler,Identifiler   Plus,Identifiler Direct试剂盒包含的基因座相同吗,引物序列相同吗?    
基因座相同,引物序列相同。    

3、    Identifiler   Plus可否用于建库样品的检测,同样,Identifiler Direct等直扩试剂盒可否用于案件样品的检测?    

每种试剂盒都是按其应用,如案件和建库,进行设计和优化的,因此都有其针对性,不建议将建库试剂盒用于案件检测,反之亦然。    

4、    Sinofiler与Huaxia试剂盒包含的基因座相同吗,引物序列相同吗?     

基因座相同,引物序列相同。  

5、    Yfiler与Yfiler   Direct试剂盒包含的基因座相同吗,引物序列相同吗?    
基因座相同,引物序列相同。  

6、    上面七款试剂盒,相同基因座的引物序列相同,这样设计对案件检测有哪些好处?    

好处在于对同一个体提供的检材,相同基因座的检测结果一定相同,极大的保持了检测结果的一致性,便于以后的数据复核工作。

7、    新的CODIS多少基因座,包含哪些基因座?    
新的CODIS包括20个基因座:CSF1PO, D3S1358, D5S818, D7S820,   D8S1179, D13S317, D16S539, D18S51, D21S11, FGA, TH01, TPOX, vWA, D1S1656,   D2S441, D2S1338, D10S1248, D12S391, D19S433, D22S1045。  

8、    GlobalFiler试剂盒包含哪些基因座?    
GlobalFiler试剂盒包含所有新的CODIS基因座,和SE33,Amelogenin,DYS391以及Y   indel。

9、    GlobalFiler试剂盒使用几色荧光?    
使用Thermo Fisher公司的六色荧光(J6),即6-FAM, VIC, NED,   TAZ, SID, LIZ。    

10、    GlobalFiler   Express及GlobalFiler试剂盒有区别有哪些?    
两款试剂盒包含的基因座相同,但GlobalFiler   Express试剂盒用于建库直扩流程,而GlobalFiler用于案件检测流程。GlobalFiler试剂盒的标准反应体系为25ul,   GlobalFiler Express试剂盒试剂盒的标准反应体系为15ul。 

11、    亲子鉴定时,单独使用Identifiler或Sinofiler试剂盒对于出现的基因座不符合情况难以判断结果,该如何操作?    
建议增加检测的基因座数,如同时使用Identifiler和Sinofiler,可将基因座增加到17个   (不包含性别基因座),如再增加GlobalFiler试剂盒,可将基因座增加至22个(不包含性别基因座)。   

12、    Yfiler Plus试剂盒包含哪些基因座?    
Yfiler   Plus试剂盒包含:DYS576,DYS389I,DYS635,DYS389II,DYS627,DYS460,DYS458,DYS19,GATA_H4,DYS448,DYS391,DYS456,DYS390,DYS438,DYS392,DYS518,DYS570,DYS437,DYS385a/b,DYS449,DYS393,DYS439,DYS481,DYF387S1a/b,DYS533。其中DYS576,DYS627,DYS518,DYS570,DYS449,   DYS387S1a/b 是快速突变基因座。    

13、    Yfiler Plus试剂盒使用几色荧光?    
使用Thermo Fisher公司的六色荧光(J6),即6-FAM, VIC, NED,   TAZ, SID, LIZ。    

14、    Yfiler   Plus试剂盒是用于建库检测还是用于案件检测?    
Yfiler Plus试剂盒在建库直扩检测和案件检测流程上均做过验证,全部流程都适用,但会选择不同的循环参数,详见说明书。   

15、    Yfiler Plus试剂盒扩增时间是多少?    
Yfiler Plus试剂盒扩增时间仅85分钟,大大缩短PCR扩增时间。    

16、    华夏白金试剂盒包含哪些基因座?    
华夏白金试剂盒包含23个常染色体 STR   基因座(D3S1358, vWA, D16S539, CSF1PO, TPOX,D8S1179, D21S11, D18S51, Penta E,   D2S441, D19S433, TH01, FGA, D22S1045,D5S818, D13S317, D7S820, D6S1043,   D10S1248, D1S1656, D12S391, D2S1338,Penta D)和两个性别标记基因座Y indel, Amelogenin。 

17、    华夏白金试剂盒使用几色荧光?    
使用Thermo Fisher公司的六色荧光(J6),即6-FAM, VIC, NED,   TAZ, SID, LIZ。    

18、    华夏白金试剂盒是用于建库检测还是用于案件检测?    
华夏白金试剂盒是用于建库检测的试剂盒。    

19、    华夏白金试剂盒扩增时间是多少?    
华夏白金试剂盒扩增时间仅45分钟,大大缩短PCR扩增时间。  

20、    同一检材样本,相同的STR基因座,使用不同公司试剂盒检测时,结果可能有差异?    
不同公司,采用的引物序列不同,对于某一样品DNA,有可能在引物结合区域存在突变,导致PCR过程中引物无法退火,产生无效等位基因,最终导致检测结果不一致。

21、    目前公司五色和六色STR试剂盒可用的LIZ内标有哪些?两者有何区? 

目前有GeneScan™ 500 LIZ®分子量内标和GeneScan™ 600   LIZ®分子量内标。LIZ  600可以用于所有五色STR荧光试剂盒,如ID   Plus,Yfiler试剂盒等及六色STR荧光试剂盒,如GlobalFiler,GlobalFiler Express, Yfiler   Plus,华夏白金试剂盒等;而LIZ 500建议用于五色STR荧光试剂盒,如ID Plus,Yfiler试剂盒等。

22、    3500遗传分析仪可以用来检测六色荧光试剂盒吗,3130遗传分析仪呢?    
3500系列遗传分析仪需要将数据收集软件(Data Collection   v1.0)升级成为v2.0及以上版本的软件,而3130系列遗传分析仪需要将数据收集软件(Data Collection   v3.0)升级成v4.0软件才可以检测六色荧光试剂盒。    

23、    六色荧光试剂盒数据使用哪款数据分析软件才能分析?    
必须使用GeneMapper® ID-X v1.4及以上版本软件才能进行正确分析。

24、    新定量试剂盒有哪些,作用分别是什么?    
新定量试剂盒包括Quantifiler® Trio Kit及Quantifiler® HP   Kit。Quantifiler®   Trio试剂盒用来定量人类总DNA量及男性DNA量,同时可以指示样品的降解程度和抑制剂含量高低;而Quantifiler® HP   Kit定量人类总DNA量,同时可以指示样品的降解程度和抑制剂含量高低。  

25、    新定量试剂盒(Trio、HP)与早期定量试剂盒(Human、Male和DUO)所适用的软件版本是什么?    
新定量试剂盒(Trio、HP)只适用于HID   Real-Time PCR Analysis Software v1.2软件。老定量试剂盒(Human、Male和DUO)适用于SDS系列版本软件和HID   Real-Time PCR Analysis Software v1.0,v1.1及v1.2版本。 

26、    新定量试剂盒的扩增时间是多少?    

新定量试剂盒的扩增时间仅1小时,比早期定量试剂盒扩增时间缩短了半小时。

27、    新定量试剂盒与早期定量试剂盒相比有哪些优势?    

新定量试剂盒具有更好的抗抑制能力及更低的检测灵敏度,低值5pg,同时新增加的降解指数可以有效判断样品的降解情况,从而使操作人员能更准确地了解样品信息,提高STR检测成功率。   

28、    ProFlex PCR仪可提供哪些模块?    
对法医实验室,有3种加热模块可供选择,其中包括3×32孔独立模块(满足小通量实验室运行不同PCR反应程序的需求)、96孔模块和双96孔高通量模块。     

29、    使用案件试剂盒时,阳性质控有时出现低峰或等位基因检测不完全的情况,什么原因?   

在案件试剂盒25uL标准反应体系中,阳性质控推荐的加样量为10uL(0.1   ng/uL)。目前很多实验采用10或12.5 uL反应体系中加入1 uL(0.1   ng/uL)的阳性质控,致使阳性质控DNA浓度太低,出现低峰或丢基因座的情况。建议加大阳性质控的量以获得最佳实验结果。 

30、    使用STR试剂盒进行扩增时出现大片段基因座丢失的现象,9947A也出现这种情况,可能的原因有哪些?    
使用不规范耗材进行PCR扩增,反应液蒸发,体系减少导致。这种情况在使用小体系进行扩增时尤为严重。请使用推荐的耗材进行扩增,并使用标准的25uL反应体系进行扩增。

31、    遗传分析仪配备UPS有什么好处?     
UPS在断电后可以由电池供电,所以在断电后还可以继续使用仪器,避免由于外界不稳定因素引起的仪器部件损坏;同时,UPS还有稳压、滤波的功能,可以保证实验结果的稳定、可靠。 

32、    控制主机的电脑在维护中要注意哪些方面?     
不要更改计算机名,不要更改网卡IP地址的设置,不要安装其它软件。    

33、    连接遗传分析仪的电脑为什么不能安装第三方软件以及杀毒软件?    
第三方软件的注册码信息会与Data   Collection软件以及GeneMapper软件的注册码发生冲突;另外,杀毒软件会把Data   Collection软件以及GeneMapper软件的注册码当成病毒清除掉,从而致使软件不能正常启动。

34、    厂家担保的毛细管使用次数是多少?     
16道毛细管为100次,4道为150次,8道和24道为160次。在担保次数范围内,如效期内的毛细管本身出现质量问题可以联系当地的技术支持进行咨询。  

35、    3500遗传分析仪在更换新的毛细管之后需要进行光谱校正吗?    

需要进行光谱校正,否则仪器无法运行。

36、    甲酰胺应该如何保存?     
首次使用时,分装成小管,–20°C进行保存。分装的量以2-3次用完为宜,避免反复冻融影响性能。

37、    POP4(35XX遗传分析仪)384或960两种型号的胶有时不够预期的电泳样品数目?    
可以满足既定样品数(384个样品或60次进样/8道或20次进样/24道;960个样品或120次进样/8道或50次进样/24道,以先到达的限定条件为准)进行电泳,但如果排气泡的次数超过4次或进行其他向导(Wizard)次数太多,造成过多的胶浪费,就无法达到既定样品的数目。    

38、    POP4保质期是多久?如何保存?    
31XX所使用的瓶装POP4和35XX所使用的袋装POP4保质期均为9个月。2℃~ 8℃进行保存,严禁–20℃保存。  

39、    刚从冰箱拿出来的POP胶有结晶,如何处理?    
POP胶里含有高浓度的尿素,低温容易造成尿素的结晶,从冰箱拿出后室温放置一段时间,晶体会消失,可以正常使用。 

40、    电泳时Ladder加样频率是如何规定的?    
按以下推荐进行加样:   
加样

41、    GeneMapper® ID-X v1.3及v 1.4软件可以安装在Microsoft® Windows® 7 Professional吗?    
GeneMapper® ID-X v1.3及v1.4版本的软件可以安装在Microsoft® Windows® 7   Professional操作系统中,但必须是32位的操作系统。同时,v1.3版本的软件也可以安装在Windows Vista® Business,Windows XP Professional ,32位的操作系统中,v1.4版本的软件也可以安装在Windows XP   (SP3),32位的操作系统中。   

42、    GeneMapper® ID-X v1.5对安装配置的要求?    

软件安装在Windows® 7 Professional(SP1),   64位操作系统中,不支持在Microsoft® Windows® 10 Professional系统上进行安装。

建议电脑配置如下:    
– i3-3240 CPU @ 3.40GHz or newer    
– 8 GB RAM    
– 10 GB available on boot drive     
– DVD-ROM drive    
– 10/100 NIC with RWU (internal) or above installed    
– TCP/IP installed    
– Supported Operating Systems    
– Windows® 7 Professional, 64-bit (Service Pack 1)   

43、    GeneMapper® ID-X   系列软件(如v1.4,v1.5)可以安装在中文操作系统中吗?
只支持英文操作系统的安装。

44、    GeneMapper® ID-X 软件为什么不能重复安装?    

每个软件均有唯一序列号(Registration   Code),如果在同一局域网内同时安装一个序列号的软件,软件之间会发生冲突,致使软件无法使用。  

45、    35XX与之前31XX和310遗传分析仪电泳生成的文件格式相同吗?    
不相同。31XX和310遗传分析仪电泳生成的文件格式为.fsa,而35XX遗传分析仪电泳生成的文件格式为.hid。    

46、    GeneMapper® ID-X   哪款软件可以分析后缀为.hid的文件?    
GeneMapper® ID-X v1.2及以上版本的软件可以分析.hid和.fsa的文件;而之前版本的软件,包括GeneMapper® ID-X   v1.0,v1.0.1,v1.1和GeneMapper® ID 3.2.1,3.3软件只能分析.fsa的文件。  

47、    GeneMapper® ID-X如何升级到最新版本(v1.5)?    
如果是GeneMapper® ID-X v1.3及以下版本,需要付费购买升级包;如果是GeneMapper® ID-X   v1.4,可以免费升级。具体请咨询当地销售人员。

48、    同一样品数据用GeneMapper   ID 3.2.1或3.3分析没有问题,但用GeneMapper® ID-X专家系统软件分析就不能通过,什么原因?    
GeneMapper® ID 3.2.1、3.3和GeneMapper® ID-X专家系统都属于数据分析软件,但每款软件的限定条件不同,GeneMapper® ID-X专家系统软件设定的条件更为严格些,因此对数据质量的要求更高,结果更精确。    

49、    使用GeneMapper® ID-X软件如何导出CODIS表格?    

样品分析好后,不含有OL及其他杂峰,在GeneMapper® ID-X软件界面的Table  Setting下拉菜单选择CODIS Export,然后将要导出的样品的Specimen   Category选择Forensic Unknown(或根据实验室具体检材类型选择),然后点击File > Export Table for   CODIS。    

50、    需要备份哪些数据?     
建议必须备份的数据是后缀为.fsa或.hid的原始样品文件,样品分析后生成的.ser文件可以根据实验室的要求确定是否需要备份。